微生物的關鍵部分對它們的宿主是特別的。它們需要某些基本營養素來生長和維持代謝功能。它們幾乎在自然界的每一個棲息地都有。由於微生物是活的,它們能够很好地將自己與植物的根聯系在一起。有幾種微生物被用來製造生物肥料。它們也可能是許多傳染病的起因。簡單地說,大多數微生物是無害的,但我們必須採取預防措施。