学科发展
1、 微生物菌种的筛选、分类、鉴定、保藏及微生物指标检测
菌种保藏中心现保藏菌1300株，涉及20个属，二百余个种。其中，真菌580余株，酵母菌200株，细菌250菌，放线菌250株，大型食用、药用真菌70余株。在此基础上开展了各种产品微生物指标检测，包括特殊微生物的检测、鉴定，微生物安全检测特别是有害微生物的快速检测等。
2、 食用、药用真菌的选育及产业化开发
在天麻、茯苓、猪苓、姬松茸等珍稀药用真菌的菌种选育、栽培技术研究方面也取得长足发展。目前开展的珍稀药用菌、优良食用菌菌种选育、引种、驯化，增加优良适栽品种，建立我省食用、药用菌生产栽培技术示范基地、开发药用菌系列产品等工作都是食用菌研究领域的前沿工作。
3、 高效微生物农药及微生物有机复合专用肥的研制与开发
通过市场考察，开展了微生物专用农药和肥料的研究。以大棚温室蔬菜及经济作物霉菌病害的抑制、拮抗为出发点，研制的微生物农药主要用于蔬菜、果树等经济作物，对西红柿霜霉病和苹果的落叶病有较好的抑制作用；微生物有机复合肥主要以农作物秸杆或农副产品为原料，经微生物发酵、处理，制
成无公害绿色肥料，变废为宝，使农副产品进一步增值。本所和外协单位合作开发的烟草专用活性复合肥就已大面积推广应用，施用效果良好。
4、 生物大分子提取及生物制药
混合核苷原料药已进入生产阶段，主要提供给陕西省科学院制药厂生产混合核苷片，目前正在规划和改造原料药车间，生产能力将进一步提高。在混合核苷生产的基础上，正在开展单核苷分离及核苷衍生物的研究工作，为本所核苷药物的发展进行积极的技术储备。
从大型药用真菌中提取有效活性成份也是该所致力的工作之一，选取了含有独特抗癌活性成份的大型真菌，通过分离活性物质，开发新型抗癌药物和保健品。自行研制的溶血栓类药物目前正在报批保健品及新药。
5、 发酵技术的研究开发
利用微生物发酵工程、酶工程技术对淀粉及农副产品进行深加工是本所开发应用工作的重点，在研究技术力量上有一批多年从事淀粉发酵技术研究及应用的科技人员做了长期大量的工作。尤其在糊精、有机酸系列产品的研究、开发方面走在全国前列。
技术推广项目
1、 异麦芽低聚糖生产技术
2、 酶法糊精生产技术
3、 β－环状糊精生产技术
4、 羟丙基β－环状糊精生产技术
5、 红霉素粉针剂的生产技术
6、 复合环状糊精生产技术
7、 乳酸盐系列产品生产技术及产品开发
8、 曲酸发酵生产技术
9、 抗癌保健食品－姬松茸冲剂及软胶囊生产技术
10、 混合核苷生产技术
11、 辣根过氧化物酶（HRP）系列产品
12、 复合微生物肥料生产技术
13、 酿造用优质种曲生产技术
14、 食用菌菌种推广和栽培技术
15、 冬虫夏草菌丝体生产技术
16、 姬松茸速溶即食营养保健麦片生产技术
17、 羊肚菌菌粉和蜜环菌多糖生产技术
18、 蜜环菌菌粉和蜜环菌多糖生产技术
19、 利用鬼伞菌开发生产降糖产品生产技术
20、 增歧常舒口服液生产技术
21、 薯蓣皂素酶法生产工艺及环保利用技术
22、 食用（药用）大型真菌系列产品生产技术
23、 食用菌快速出菇增产剂
